El Colegio de San Juan se fundó en el año de 1548 en la Ciudad de México, en esos lejanos tiempos se le llamó Colegio para Mestizos, nombre que recibió ya que su objetivo se centraba en la educación de los niños mestizos, grupo que cada día iban en aumento y cuyos integrantes casi siempre eran hijos ilegítimos, nacidos de españoles e indias.